Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN4Q9UHM6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN4Q9UHM6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN4Q9UHM6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN4Q9UHM6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPN4Q9UHM6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN4Q9UHM6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN4Q9UHM6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN4Q9UHM6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms