Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC23A1Q9UHI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC23A1Q9UHI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC23A1Q9UHI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC23A1Q9UHI7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC23A1Q9UHI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC23A1Q9UHI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms