Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCDC2Q9UHG0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCDC2Q9UHG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCDC2Q9UHG0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCDC2Q9UHG0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DCDC2Q9UHG0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCDC2Q9UHG0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC2Q9UHG0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCDC2Q9UHG0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCDC2Q9UHG0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DCDC2Q9UHG0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCDC2Q9UHG0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCDC2Q9UHG0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCDC2Q9UHG0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms