Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMTOR3Q9UHA4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMTOR3Q9UHA4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMTOR3Q9UHA4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMTOR3Q9UHA4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms