Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN2A-AS1Q9UH64 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN2A-AS1Q9UH64 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN2A-AS1Q9UH64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms