Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms