Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM10Q9UDY6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM10Q9UDY6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM10Q9UDY6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM10Q9UDY6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM10Q9UDY6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM10Q9UDY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM10Q9UDY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM10Q9UDY6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM10Q9UDY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM10Q9UDY6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM10Q9UDY6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM10Q9UDY6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM10Q9UDY6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM10Q9UDY6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM10Q9UDY6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms