Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REV1Q9UBZ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REV1Q9UBZ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REV1Q9UBZ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
REV1Q9UBZ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
REV1Q9UBZ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REV1Q9UBZ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV1Q9UBZ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REV1Q9UBZ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms