Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CPNE7Q9UBL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPNE7Q9UBL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPNE7Q9UBL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPNE7Q9UBL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE7Q9UBL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPNE7Q9UBL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms