Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LRP2BPQ9P2M1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRP2BPQ9P2M1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRP2BPQ9P2M1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRP2BPQ9P2M1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRP2BPQ9P2M1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRP2BPQ9P2M1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
LRP2BPQ9P2M1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRP2BPQ9P2M1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRP2BPQ9P2M1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRP2BPQ9P2M1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LRP2BPQ9P2M1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
LRP2BPQ9P2M1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRP2BPQ9P2M1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRP2BPQ9P2M1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRP2BPQ9P2M1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRP2BPQ9P2M1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRP2BPQ9P2M1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRP2BPQ9P2M1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP2BPQ9P2M1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRP2BPQ9P2M1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRP2BPQ9P2M1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRP2BPQ9P2M1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRP2BPQ9P2M1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms