Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LARSQ9P2J5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LARSQ9P2J5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LARSQ9P2J5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LARSQ9P2J5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARSQ9P2J5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARSQ9P2J5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARSQ9P2J5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARSQ9P2J5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARSQ9P2J5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARSQ9P2J5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARSQ9P2J5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARSQ9P2J5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARSQ9P2J5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARSQ9P2J5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARSQ9P2J5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms