Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP1BQ9NZR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRP1BQ9NZR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP1BQ9NZR2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP1BQ9NZR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP1BQ9NZR2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms