Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC27Q9NZQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC27Q9NZQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJC27Q9NZQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC27Q9NZQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC27Q9NZQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC27Q9NZQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJC27Q9NZQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms