Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TVP23BQ9NYZ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TVP23BQ9NYZ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TVP23BQ9NYZ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TVP23BQ9NYZ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TVP23BQ9NYZ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TVP23BQ9NYZ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TVP23BQ9NYZ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TVP23BQ9NYZ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TVP23BQ9NYZ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms