Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CDK12Q9NYV4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDK12Q9NYV4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CDK12Q9NYV4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK12Q9NYV4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CDK12Q9NYV4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CDK12Q9NYV4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CDK12Q9NYV4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK12Q9NYV4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK12Q9NYV4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK12Q9NYV4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CDK12Q9NYV4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDK12Q9NYV4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK12Q9NYV4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CDK12Q9NYV4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CDK12Q9NYV4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CDK12Q9NYV4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK12Q9NYV4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK12Q9NYV4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK12Q9NYV4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDK12Q9NYV4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDK12Q9NYV4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDK12Q9NYV4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CDK12Q9NYV4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CDK12Q9NYV4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CDK12Q9NYV4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CDK12Q9NYV4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CDK12Q9NYV4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CDK12Q9NYV4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CDK12Q9NYV4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CDK12Q9NYV4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CDK12Q9NYV4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CDK12Q9NYV4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CDK12Q9NYV4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CDK12Q9NYV4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CDK12Q9NYV4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CDK12Q9NYV4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK12Q9NYV4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDK12Q9NYV4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms