Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NKIRAS2Q9NYR9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKIRAS2Q9NYR9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKIRAS2Q9NYR9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKIRAS2Q9NYR9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKIRAS2Q9NYR9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms