Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR7

BABAM2, BRISC and BRCA1-A complex member 2, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BABAM2Q9NXR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BABAM2Q9NXR7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BABAM2Q9NXR7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BABAM2Q9NXR7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BABAM2Q9NXR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BABAM2Q9NXR7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BABAM2Q9NXR7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BABAM2Q9NXR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BABAM2Q9NXR7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BABAM2Q9NXR7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BABAM2Q9NXR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BABAM2Q9NXR7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms