Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM160Q9NX00 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM160Q9NX00 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM160Q9NX00 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM160Q9NX00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM160Q9NX00 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM160Q9NX00 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM160Q9NX00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM160Q9NX00 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM160Q9NX00 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM160Q9NX00 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms