Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CISHQ9NSE2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CISHQ9NSE2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CISHQ9NSE2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CISHQ9NSE2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CISHQ9NSE2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CISHQ9NSE2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CISHQ9NSE2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CISHQ9NSE2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CISHQ9NSE2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CISHQ9NSE2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CISHQ9NSE2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CISHQ9NSE2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CISHQ9NSE2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CISHQ9NSE2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CISHQ9NSE2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CISHQ9NSE2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CISHQ9NSE2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CISHQ9NSE2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CISHQ9NSE2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CISHQ9NSE2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms