Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOMER3Q9NSC5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOMER3Q9NSC5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER3Q9NSC5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOMER3Q9NSC5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOMER3Q9NSC5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOMER3Q9NSC5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOMER3Q9NSC5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER3Q9NSC5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER3Q9NSC5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER3Q9NSC5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOMER3Q9NSC5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOMER3Q9NSC5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER3Q9NSC5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms