Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BIN3Q9NQY0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BIN3Q9NQY0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BIN3Q9NQY0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BIN3Q9NQY0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BIN3Q9NQY0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN3Q9NQY0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN3Q9NQY0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN3Q9NQY0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BIN3Q9NQY0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BIN3Q9NQY0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BIN3Q9NQY0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms