Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM36Q9NQ86 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM36Q9NQ86 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM36Q9NQ86 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM36Q9NQ86 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM36Q9NQ86 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM36Q9NQ86 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM36Q9NQ86 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms