Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LHX9Q9NQ69 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX9Q9NQ69 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LHX9Q9NQ69 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LHX9Q9NQ69 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX9Q9NQ69 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX9Q9NQ69 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX9Q9NQ69 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms