Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC1

LTB4R2, Leukotriene B4 receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB4R2Q9NPC1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTB4R2Q9NPC1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTB4R2Q9NPC1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTB4R2Q9NPC1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTB4R2Q9NPC1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTB4R2Q9NPC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTB4R2Q9NPC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LTB4R2Q9NPC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTB4R2Q9NPC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTB4R2Q9NPC1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTB4R2Q9NPC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTB4R2Q9NPC1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTB4R2Q9NPC1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTB4R2Q9NPC1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTB4R2Q9NPC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTB4R2Q9NPC1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTB4R2Q9NPC1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTB4R2Q9NPC1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTB4R2Q9NPC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTB4R2Q9NPC1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTB4R2Q9NPC1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTB4R2Q9NPC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LTB4R2Q9NPC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTB4R2Q9NPC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTB4R2Q9NPC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LTB4R2Q9NPC1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms