Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB9BQ9NP90 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB9BQ9NP90 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB9BQ9NP90 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB9BQ9NP90 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB9BQ9NP90 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB9BQ9NP90 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms