Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZCCHC17Q9NP64 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZCCHC17Q9NP64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZCCHC17Q9NP64 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZCCHC17Q9NP64 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZCCHC17Q9NP64 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZCCHC17Q9NP64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZCCHC17Q9NP64 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZCCHC17Q9NP64 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZCCHC17Q9NP64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZCCHC17Q9NP64 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZCCHC17Q9NP64 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZCCHC17Q9NP64 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZCCHC17Q9NP64 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZCCHC17Q9NP64 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZCCHC17Q9NP64 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ZCCHC17Q9NP64 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZCCHC17Q9NP64 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZCCHC17Q9NP64 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZCCHC17Q9NP64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZCCHC17Q9NP64 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZCCHC17Q9NP64 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ZCCHC17Q9NP64 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZCCHC17Q9NP64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZCCHC17Q9NP64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZCCHC17Q9NP64 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZCCHC17Q9NP64 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZCCHC17Q9NP64 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZCCHC17Q9NP64 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms