Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK6Q9HC98 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEK6Q9HC98 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEK6Q9HC98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK6Q9HC98 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEK6Q9HC98 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK6Q9HC98 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms