Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC24A3Q9HC58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC24A3Q9HC58 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC24A3Q9HC58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC24A3Q9HC58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC24A3Q9HC58 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC24A3Q9HC58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC24A3Q9HC58 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms