Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARVBQ9HBI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARVBQ9HBI1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARVBQ9HBI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARVBQ9HBI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVBQ9HBI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVBQ9HBI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVBQ9HBI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARVBQ9HBI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms