Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP6

LIN7B, Protein lin-7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7BQ9HAP6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN7BQ9HAP6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN7BQ9HAP6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN7BQ9HAP6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN7BQ9HAP6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN7BQ9HAP6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN7BQ9HAP6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN7BQ9HAP6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms