Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1BQ9H9Y6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1BQ9H9Y6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1BQ9H9Y6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1BQ9H9Y6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR1BQ9H9Y6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1BQ9H9Y6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1BQ9H9Y6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1BQ9H9Y6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1BQ9H9Y6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1BQ9H9Y6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1BQ9H9Y6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1BQ9H9Y6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1BQ9H9Y6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1BQ9H9Y6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms