Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5K3

POMK, Protein O-mannose kinase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMKQ9H5K3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POMKQ9H5K3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POMKQ9H5K3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POMKQ9H5K3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POMKQ9H5K3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POMKQ9H5K3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POMKQ9H5K3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POMKQ9H5K3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POMKQ9H5K3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POMKQ9H5K3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POMKQ9H5K3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POMKQ9H5K3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POMKQ9H5K3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POMKQ9H5K3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POMKQ9H5K3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POMKQ9H5K3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POMKQ9H5K3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POMKQ9H5K3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POMKQ9H5K3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POMKQ9H5K3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POMKQ9H5K3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POMKQ9H5K3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POMKQ9H5K3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms