Protein–RNA interactions for Protein: Q9H426

RIMS4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS4Q9H426 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMS4Q9H426 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS4Q9H426 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMS4Q9H426 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS4Q9H426 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS4Q9H426 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms