Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GGNBP2Q9H3C7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GGNBP2Q9H3C7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GGNBP2Q9H3C7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GGNBP2Q9H3C7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GGNBP2Q9H3C7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GGNBP2Q9H3C7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GGNBP2Q9H3C7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GGNBP2Q9H3C7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GGNBP2Q9H3C7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GGNBP2Q9H3C7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GGNBP2Q9H3C7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GGNBP2Q9H3C7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GGNBP2Q9H3C7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GGNBP2Q9H3C7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GGNBP2Q9H3C7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GGNBP2Q9H3C7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GGNBP2Q9H3C7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GGNBP2Q9H3C7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
GGNBP2Q9H3C7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GGNBP2Q9H3C7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GGNBP2Q9H3C7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
GGNBP2Q9H3C7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
GGNBP2Q9H3C7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GGNBP2Q9H3C7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GGNBP2Q9H3C7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GGNBP2Q9H3C7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GGNBP2Q9H3C7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
GGNBP2Q9H3C7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GGNBP2Q9H3C7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GGNBP2Q9H3C7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms