Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W6

MRPL46, 39S ribosomal protein L46, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL46Q9H2W6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL46Q9H2W6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRPL46Q9H2W6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL46Q9H2W6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL46Q9H2W6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL46Q9H2W6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL46Q9H2W6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL46Q9H2W6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL46Q9H2W6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL46Q9H2W6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MRPL46Q9H2W6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPL46Q9H2W6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL46Q9H2W6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL46Q9H2W6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms