Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG5Q9H1Y0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG5Q9H1Y0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG5Q9H1Y0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG5Q9H1Y0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG5Q9H1Y0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG5Q9H1Y0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG5Q9H1Y0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG5Q9H1Y0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG5Q9H1Y0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG5Q9H1Y0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG5Q9H1Y0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG5Q9H1Y0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG5Q9H1Y0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG5Q9H1Y0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms