Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NACA2Q9H009 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NACA2Q9H009 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NACA2Q9H009 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NACA2Q9H009 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NACA2Q9H009 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NACA2Q9H009 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NACA2Q9H009 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NACA2Q9H009 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACA2Q9H009 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NACA2Q9H009 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NACA2Q9H009 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NACA2Q9H009 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NACA2Q9H009 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACA2Q9H009 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NACA2Q9H009 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NACA2Q9H009 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACA2Q9H009 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NACA2Q9H009 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NACA2Q9H009 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms