Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF407Q9C0G0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF407Q9C0G0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF407Q9C0G0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF407Q9C0G0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF407Q9C0G0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF407Q9C0G0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms