Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHCBP1LQ9BZQ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHCBP1LQ9BZQ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHCBP1LQ9BZQ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHCBP1LQ9BZQ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHCBP1LQ9BZQ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHCBP1LQ9BZQ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHCBP1LQ9BZQ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHCBP1LQ9BZQ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHCBP1LQ9BZQ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHCBP1LQ9BZQ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms