Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP7

WNK3, Serine/threonine-protein kinase WNK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNK3Q9BYP7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
WNK3Q9BYP7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
WNK3Q9BYP7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
WNK3Q9BYP7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
WNK3Q9BYP7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
WNK3Q9BYP7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
WNK3Q9BYP7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
WNK3Q9BYP7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
WNK3Q9BYP7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
WNK3Q9BYP7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
WNK3Q9BYP7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
WNK3Q9BYP7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
WNK3Q9BYP7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
WNK3Q9BYP7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
WNK3Q9BYP7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
WNK3Q9BYP7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
WNK3Q9BYP7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
WNK3Q9BYP7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
WNK3Q9BYP7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
WNK3Q9BYP7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
WNK3Q9BYP7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
WNK3Q9BYP7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
WNK3Q9BYP7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
WNK3Q9BYP7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
WNK3Q9BYP7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
WNK3Q9BYP7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
WNK3Q9BYP7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
WNK3Q9BYP7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
WNK3Q9BYP7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
WNK3Q9BYP7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
WNK3Q9BYP7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
WNK3Q9BYP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
WNK3Q9BYP7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
WNK3Q9BYP7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
WNK3Q9BYP7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
WNK3Q9BYP7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
WNK3Q9BYP7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
WNK3Q9BYP7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
WNK3Q9BYP7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
WNK3Q9BYP7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
WNK3Q9BYP7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
WNK3Q9BYP7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
WNK3Q9BYP7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
WNK3Q9BYP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
WNK3Q9BYP7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
WNK3Q9BYP7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
WNK3Q9BYP7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
WNK3Q9BYP7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
WNK3Q9BYP7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
WNK3Q9BYP7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
WNK3Q9BYP7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
WNK3Q9BYP7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
WNK3Q9BYP7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
WNK3Q9BYP7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
WNK3Q9BYP7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
WNK3Q9BYP7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
WNK3Q9BYP7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
WNK3Q9BYP7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
WNK3Q9BYP7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms