Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE2

TMPRSS13, Transmembrane protease serine 13, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS13Q9BYE2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS13Q9BYE2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS13Q9BYE2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS13Q9BYE2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS13Q9BYE2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS13Q9BYE2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS13Q9BYE2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS13Q9BYE2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS13Q9BYE2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS13Q9BYE2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS13Q9BYE2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS13Q9BYE2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS13Q9BYE2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS13Q9BYE2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS13Q9BYE2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS13Q9BYE2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms