Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUSAP1Q9BXS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUSAP1Q9BXS6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUSAP1Q9BXS6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUSAP1Q9BXS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUSAP1Q9BXS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUSAP1Q9BXS6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NUSAP1Q9BXS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUSAP1Q9BXS6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUSAP1Q9BXS6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUSAP1Q9BXS6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUSAP1Q9BXS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUSAP1Q9BXS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUSAP1Q9BXS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUSAP1Q9BXS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms