Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP58Q9BVL2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP58Q9BVL2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP58Q9BVL2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP58Q9BVL2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP58Q9BVL2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP58Q9BVL2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP58Q9BVL2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP58Q9BVL2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP58Q9BVL2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP58Q9BVL2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP58Q9BVL2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP58Q9BVL2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP58Q9BVL2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP58Q9BVL2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP58Q9BVL2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP58Q9BVL2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP58Q9BVL2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP58Q9BVL2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms