Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTDSS2Q9BVG9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTDSS2Q9BVG9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTDSS2Q9BVG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTDSS2Q9BVG9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTDSS2Q9BVG9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS2Q9BVG9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTDSS2Q9BVG9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTDSS2Q9BVG9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTDSS2Q9BVG9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS2Q9BVG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms