Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD3Q9BV44 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD3Q9BV44 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD3Q9BV44 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD3Q9BV44 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD3Q9BV44 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD3Q9BV44 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THUMPD3Q9BV44 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THUMPD3Q9BV44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THUMPD3Q9BV44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
THUMPD3Q9BV44 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD3Q9BV44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms