Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NICN1Q9BSH3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NICN1Q9BSH3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NICN1Q9BSH3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NICN1Q9BSH3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NICN1Q9BSH3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NICN1Q9BSH3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms