Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF4Q9BQW3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF4Q9BQW3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF4Q9BQW3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EBF4Q9BQW3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF4Q9BQW3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EBF4Q9BQW3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF4Q9BQW3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF4Q9BQW3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EBF4Q9BQW3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms