Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
C19orf43Q9BQ61 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C19orf43Q9BQ61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C19orf43Q9BQ61 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C19orf43Q9BQ61 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C19orf43Q9BQ61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C19orf43Q9BQ61 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C19orf43Q9BQ61 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C19orf43Q9BQ61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C19orf43Q9BQ61 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C19orf43Q9BQ61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C19orf43Q9BQ61 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C19orf43Q9BQ61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C19orf43Q9BQ61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C19orf43Q9BQ61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C19orf43Q9BQ61 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms