Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VGLL1Q99990 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL1Q99990 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL1Q99990 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
VGLL1Q99990 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VGLL1Q99990 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms