Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BARD1Q99728 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARD1Q99728 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARD1Q99728 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BARD1Q99728 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARD1Q99728 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARD1Q99728 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BARD1Q99728 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BARD1Q99728 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BARD1Q99728 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARD1Q99728 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARD1Q99728 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 351.6 ms